BREVE DESCRIÇÃO:
O Laboratório Multiusuário de Proteômica e Biomoléculas do Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas (NUPEB) da UFOP é um dos seis laboratórios que compõem a Central Multiusuária do NUPEB/UFOP. Trata-se de um laboratório que dispõe de tecnologias ímpares no Estado de Minas Gerais para a análise de biomoléculas por espectrometria de massas, em particular análise proteômica em larga escala, utilizando tecnologia orbitrap. A infraestrutura bem como as principais técnicas e serviços disponbilizados pelo LMU-ProtBio estão listados abaixo.
PRINCIPAIS TÉCNICAS:
- Análise proteômica em larga escala utilizando estratégia bottom-up, com tecnologia orbitrap; - Análise e interrogação de dados espectrais utilizando softwares (PEAKs, Rawmeat, Proteome Discoverer); - Centrifugação e ultracentrifugação de amostras; - Extração em fase sólida; - Evaporação de amostras;
PRINCIPAIS SERVIÇOS DISPONIBILIZADOS:
O principal equipamento disponível na plataforma é de um Cromatógrafo Liquido acoplado ao Espectrômetro de massas Q-Exactive. Trata-se de um equipamento híbrido do tipo Quadrupolo-Orbitrap o qual permite identificar, quantificar e confirmar moléculas com alta processividade e acurácia. O sistema LC-MS/MS combina a seleção de íon precursor pelo quadrupolo com alta resolução e massa exata do Orbitrap, possibilitando maior desempenho e versatilidade. O Q-Exactive é igualmente adequado para a triagem de compostos alvo ou desconhecidos, assim como para uma vasta gama de aplicações qualitativas e quantitativas em proteômica, ambiental, segurança em alimentos, pesquisa clínica e toxicológica. Trata-se, portanto, de um equipamento com alto potencial de geração de dados em larga escala, imprescindíveis para pesquisas envolvendo caracterização de biomoléculas.
Outros serviços e técnicas disponibilizados incluem: análise e interrogação de dados espectrais utilizando softwares disponíveis, extração em fase sólida, centrifugação e ultracentrifugação, evaporação, digestão de amostras em termobloco.
LISTAGEM DAS INSTALAÇÕES E EQUIPAMENTOS DISPONÍVEIS:
No LMU-ProtBio os equipamentos multiusuários estão devidamente instalados em área total de 120 m2. O LMU-ProtBio dispõe de ambiente individualizado (12 m2) por alvenaria e parede de vidro para abrigar a principal plataforma multiusuária do laboratório, dotada de rede elétrica estabilizada e refrigeração mantida a -20ºC por ar-condicionado próprio. Neste ambiente inclui-se também uma bancada com sistema de amortecimento de impacto utilizada para acomodar os equipamentos da plataforma de espectrometria de massas. Todos os principais insumos da plataforma como pequenas peças de reposição são mantidos em gaveteiros e armários fixos de parede devidamente projetados. Ademais, uma bancada em L oferece espaço suficiente para a manipulação final de amostras. A maior área do LMU-ProtBio é mantida refrigerada e oferece utilização e circulação com biossegurança para os usuários. Possui armários e bancadas para acondicionamento de material de consumo e demais equipamentos para a experimentação. No LMU-ProtBio as instalações hidráulicas, elétricas e internet fixa e wifi são rotineiramente mantidas em pleno funcionamento. Os equipamentos são classificados como de grande, médio e pequeno porte e estão listados a seguir: plataforma composta por um Espectrômetro de Massas Orbitrap Q-EXACTIVE (Thermo) contendo fonte NanoESI Proxeon Nanospray Flex (Com câmera acoplada) e HESI II com bomba de seringa para infusão direta (Chemix Fusion 100) e sistema de acoplamento em cromatógrafo líquido. Sistema de cromatografia Dionex - Ultimate3000 RSLCnano (Thermo Scientific), com sistema de bombeamento de solventes integrado em escala nano, desgaseificação de solventes para 6 canais modelo SRD-3600, sistema de auto-injeção de amostras com termostatizador modelo Ultimate WPS3000TPLRS, detector de UV-Vis de 4 canais VWD-3400 200Hz com cela de fluxo contínuo VWD. Gerador de N2 (Peak Scientific) modelo Genius 1022. No-Break (CM comandos) linha selection SP, modelo 10000. Bomba de vácuo rotativa para pré-vácuo com isolamento acústico. Sistema de concentração de amostras (Christ) modelo RVC 2-18 com rotor para microtubos e bomba de vácuo acoplada. Dois computadores, um Optiplex 990 (para controle do cromatógrafo e espectrômetro de massas via Softwares Chromeleon, Tune e Xcalibur) com processador Intel Core i3 2120 de 3.3 GHz, memória RAM de 4 GB, memória HD de 2 Tera e um computador Dell Precision T5600 (para análise de dados) com processador Intel Xeon CPU E5-2620 de 2.0 GHz, memória RAM de 16 GB, memória HD de 2 Tera. Software Proteome Discoverer 1.3 (para análise de dados de proteômica). Software PEAKS Studio v8.5 com módulo de quantificação (Bioinformatics Solutions Inc.). Liofilizador: Virtis Benchtop 4KBTZL 105. Outra plataforma já adquirida e em processo de instalação trata-se do equipamento Cromatógrafo de Fase Liquida, Waters,modelo ACQUITY UPLC M-Class acoplado ao Espectrômetro de massa triplo quadrupolo tandem- modelo Xevo TQ-XS. A plataforma é equipada com gerador de nitrogênio, No-Break e bomba de vácuo, além de computador e softwares para operação. Contamos ainda com: Ultracentrífuga refrigerada, de alta performance, modelo Optima XPN, marca Beckman. Possui velocidade máxima de 100.000rpm e RCF máxima de 802.400 xg (Optima XPN 100); Liofilizador de amostras Benchtop K; Leitor de Microplaca TP-Reader; Concentrador de amostras à vácuo por rotação, RVC 2-18 CD PLUS; Centrífuga para microtubos com controle de temperatura - Mikro 200R; Sistema de extração em fase sólida com bomba de vácuo.
SETOR/DEPARTAMENTO/LABORATÓRIO DA INSTITUIÇÃO NO QUAL ESTÁ VINCULADO O SISTEMA MULTIUSUÁRIO:
Instituto de Ciências Exatas e Biológicas (ICEB)
Departamento de Ciências Biológicas (DECBI)
Laboratório de Proteômica e Biomoléculas (LMU-ProtBio)
ENDEREÇO DO SISTEMA MULTIUSUÁRIO:
Laboratório Multiusuário de Proteômica e Biomoléculas (LMU-ProtBio), sala 58, Instituto de Ciências Exatas e Biológicas-ICEB II; Universidade Federal de Ouro Preto, Campus Morro do Cruzeiro s/n, Ouro Preto-MG, CEP 35402-136
INFORMAÇÕES PARA CONTATO:
Coordenador do LMU-ProtBio: Prof. William de Castro Borges;
Técnico Responsável do LMU-ProtBio: Dr. Camilo Elber Vital
wborges@ufop.edu.br
(31) 3559-1705
WEBSITE DO SISTEMA MULTIUSUÁRIO:
LINKS ÚTEIS:
