Para cumprir seus objetivos, a FAPEMIG apoia a pesquisa e a inovação científica e tecnológica a partir da concessão de recursos financeiros, tais como auxílios e bolsas. As diversas modalidades de fomento e seus programas específicos são apresentados no Caderno de Modalidade de Fomentos.

As propostas para solicitação de financiamento dentro das modalidades disponíveis são submetidas à FAPEMIG por meio de chamadas públicas. As propostas passam pela avaliação dos especialistas que compõem as Câmaras de Avaliação de Projetos, as quais recomendam, ou não, o apoio solicitado. A decisão final cabe à Diretoria Executiva da FAPEMIG e, em situações especiais, ao Conselho Curador. A FAPEMIG assegura ao solicitante o direito de pleitear reconsideração de pareceres e decisões junto à Diretoria Executiva.